本學程提供建築碩士 Master in Architecture II (M.Arch. II)，為專業後學位（Post-professional Degree）。本組招收已經取得五年或四年建築專業學士學位（Bachelor of Architecture），對建築相關專業、跨域研究、規劃與策略有高度熱忱之大學畢業生 。
本組與數位設計組合併以「設計研究(Design Research)組」招生。報考本組時，請選擇「甲組（主修設計研究）」，並於考生資料表勾選專長領域「建築設計」。
本組為高階建築設計教育之主流，目標在結合數位、設計與其他跨領域專業之整合與創新，故非常鼓勵本組學生跨組選修、發展高階設計研究；本所將藉此學程培育台灣數位時代建築設計、合作共創、創新設計、城市設計的領導人才。
本組修業第一學期結束時，可選擇領域分流，朝建築設計研究（建築碩士）或數位設計研究（理學碩士）方向。
本所邀請得獎知名建築師教授建築設計課程，每年安排國際建築師、設計師舉辦設計工作坊，並鼓勵學生參加國際競圖、國際建築展、建築旅行或專案實習，期望學生建立國際視野與環境敏感度。本組核心課程除進階之建築設計課外，需與數位設計組共同修習設計運算基礎、設計研究方法學，並鼓勵本組學生跨組選修數位媒材相關課程，培養學生面對數位時代的整合性設計能力、運用先進科技於設計研究之能力。本組向來募集到國內最優秀的設計師資與學生，師生常於國內外競圖得獎、參與國際建築展，近年更有學生自主啟動社會設計、社會共創專案，以行動進行學習、實務驗證。
修滿 28 學分，含 2 門建築設計、1 門設計研究方法、6 門專題。
畢業設計須通過「設計口試委員會」審核，並參加國內外競圖入圍。
